“ NoBody” –任务中的微蛋白
人肾细胞被P体标记(红色)和NoBody(绿色)染色。黄点是P实体和NoBody相互作用的地方。细胞核以蓝色显示。(耶鲁大学)
耶鲁大学的科学家采用了一种技术,该技术揭示了400多种新蛋白质,这些蛋白质太小而无法通过其他手段发现,从而帮助鉴定了人类基因组中编码的新型功能性“微蛋白质”。
这些微蛋白中的一种被称为NoBody,是一种分子重要分子,它参与清除细胞内不需要的遗传物质。研究人员说,它的发现可能表明存在着与许多关键生物学机制和疾病有关的其他微蛋白。
“这项工作的最广泛的意义是,即使在经过深入研究的生物学过程中,一直以来我们的鼻子下都一直存在着一种未被检测到的微蛋白,” 12月5日发表在《 《自然化学生物学》杂志。
Slavoff是耶鲁大学的化学以及分子生物物理学和生物化学的助理教授。她是耶鲁大学西校区化学生物学研究所的成员。
该研究的第一作者是Slavoff实验室的研究员Nadia D’Lima。Salk生物研究所的Alan Saghatelian是该研究的另一位合著者。
Saghatelian说:“尽管我们对人类基因组了解多少,但在基因组发现算法中仍然存在盲点。”“您可以对整个人类基因组进行测序,却永远不会知道像这样的蛋白质在那里,因为它太短并且低于基因分配算法通常的长度要求。”
在先前的工作中,研究人员通过检查髓样白血病细胞并去除较大的蛋白来开始寻找微蛋白。他们使用了一种分析化学技术,即液相色谱-质谱分析蛋白质组学,来查找每种剩余蛋白质的氨基酸序列。
接下来,研究人员开发了一种计算方法,以建立样品中所有可能的微蛋白的数据库。从该数据库中,Slavoff和她的同事发现了400多种新的微蛋白。
该研究集中在一种名为NoBody的微蛋白上,该蛋白代表无注释的P体解离多肽。研究人员发现,NoBody是细胞中回收mRNA的关键成分,而mRNA是产生蛋白质的遗传蓝图。
斯拉夫夫说,这一发现暗示着微蛋白可能在许多生物过程以及疾病中起重要作用。例如,许多神经系统疾病都具有蛋白质分组的特征。
该研究的其他作者包括耶鲁大学的Lauren Winkler,Salk研究所的Jiao Ma和Qian Chu,麻省理工学院的Ken H. Loh,Elizabeth O. Corpuz和加利福尼亚大学圣地亚哥分校的Jens Lykke-Anderson,哈佛大学的Bogdan A Budnik。
该研究由乔治·休伊特医学研究基金会的博士后研究基金,美国国立卫生研究院,利昂娜·M·哈里·B·赫尔姆斯利慈善信托基金以及弗雷德里克·保尔森博士/ Ferring Pharmaceuticals资助。
出版物:Sarah A Slavoff等人,“人细胞中短开放阅读框编码的肽的肽组发现”,《自然化学生物学》 9,59-64(2013)doi:10.1038 / nchembio.1120
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